招标详情
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**** **** 竞采结果公告
| 项目名称 | 张明杰课题组免疫肽组分析项目采购 |
| 项目编号 | **** |
| 项目类型 | 服务类 |
| 成交方式 | 最低价成交 |
| 公示时间 | 本公告自发布之日起三日 |
| 成交单位 | **** |
| 成交金额(元) | 82500.00 |
| 成交理由 | 最低价成交 |
| 预算(元) | 85000.0 |
| 备注 | 请按“采购明细”提示中的要求上传《供应商基本情况表》,未按要求上传则响应无效。 |
响 应 情 况 | 采购明细 |
| 序号 | 名称 | 数量 | 单位 | 单价/元(报价) | 总价/元(报价) |
| 1 | 免疫肽组分析 | 11 | 例 | 7500.0 | 82500.0 |
| 服务内容 | 免疫肽组序列差异分析,主要是针对肿瘤组织与正常组织、给药前后、不同细胞系或不同患者之间,经 LC-MS/MS 鉴定到的 HLA 递呈肽段,从序列层面进行系统的挖掘与比较。整体服务大致分为序列特征比较、差异肽筛选、修饰与结构分析、以及下游生物学注释三个部分。
第一部分是序列基本特征的组间比较。 我们会先统计两组肽段的长度分布,重点看九肽、十肽所占比例,同时比较分子量、等电点和疏水性在两组间的差异。长度和理化性质的不同,往往能反映 HLA 亚型偏好或蛋白酶体剪切模式的改变,这是理解递呈组差异的基础。
第二部分是 HLA 结合基序的提取与对比。 对两组肽段分别做结合 motif 分析,生成 sequence logo,重点考察 P1、P2、PΩ 等锚定位点的氨基酸偏好,** P2 位偏向亮氨酸、缬氨酸,C 末端偏向酪氨酸、苯丙氨酸等特征。通过两组 logo 的并排比较,可以识别锚定氨基酸使用上的偏移,进而判断是否发生了 HLA 亚型切换或抗原加工通路的改变。
第三部分是差异肽段的筛选与氨基酸频率分析。 对有定量信息的肽段做两组间的倍数变化和显著性检验,筛选出上调、下调以及仅在某一组中特异性出现的肽段,也就是所谓的"独有肽"。同时,我们会逐位点统计 P1 到 P9 的氨基酸使用频率,做两组对比热图,识别类似丙氨酸向苏氨酸这类偏好性替换的位点,这些位点往往与 T 细胞识别表位的强弱直接相关。 | | 服务期限 | 服务期限1年 | | 售后要求 | 无 | |
| 付款方式 | 合同生效、服务完成,且收到相应发票后 10 日内,支付合同总金额 100%。 |